Moni1000_UAVLiDAR_Crowns20250701223921-DIAS20221121113753-ja Japanese 竹重龍一 大阪公立大学 2025-07-01 DIAS Core Metadata Profile (based-on ISO 19115:2003/19139) 1.0(draft) 0 false 全国天然林試験区_高解像度地形・森林構造・樹冠データ 2025-03-07 2025-03-27 2025-06-27 ver. 2.0 DIAS (Data Integration and Analysis System) 669:Moni1000_UAVLiDAR_Crowns IDF (International DOI Foundation) doi:10.20783/DIAS.669 デジタル地形モデル（DTM）を作成する際、検出アルゴリズムで抽出された地上点が正しいものかを目視で判読し、ノイズが含まれる場合は手動で修正した。また、与那の樹冠データは、調査区の60%程度しかカバーできていない。これは、小さな樹冠の樹木が多く、フィールドワークに非常に時間がかかったためである。 全国の調査区において、樹冠の樹種を特定できないケースがいくつかあった。 これは、樹木のタグがなかった、実際のタグの番号と公開されている調査データの番号とが一致しなかった、フィールドワーク中にタグを読み違えたりしたためである。 このような不確実性のある樹冠は、データセットの"confidence"欄に"low"と記してある。 このデータセットには、UAV-LiDAR測量と現地調査によって作成した以下の４種類のデータが含まれる。 １．電子地形モデル（DTMs, 空間解像度5 cm） ２．電子樹冠高モデル（CHMs, 空間解像度5 cm） ３．オルソモザイク画像（空間解像度2.2-2.6 cm） ４．樹冠ポリゴン（151種・4328樹冠、最新のモニ1000公開データの胸高周囲長・2の樹冠高情報と紐づけ済み） 調査は、環境省モニタリングサイト1000プロジェクトに登録されている日本全国22カ所の森林調査区（各プロット約1ヘクタール）にて実施した。これらの調査区は、日本の主要な気候帯（亜熱帯から亜寒帯）と森林タイプ（常緑針葉樹林・広葉樹と針葉樹の混交した落葉広葉樹林・常緑広葉樹林）を網羅している。調査期間は2022年5月から2023年10月にかけてで、UAVの飛行と樹冠調査とを同時に実施した。 このデータセットの詳細は、以下のデータペーパーに記載されている。（http://doi.org/10.1111/1440-1703.12555） 2025/6/27 更新メモ： 2024/9/30に実施された環境省モニタリングサイト1000の毎木データセットの更新に伴い、樹冠データセットの更新作業を行いました（TreeDataPackage2022ver2.zipに含まれる毎木データセットを使用）。更新されたCrown_ver2には、149種4304樹冠のデータが含まれます。本作業に伴い、従来の樹冠データセットを以下のように更新・修正しました。 1. 重複樹冠の削除 一部の樹冠で重複が見られたため、削除しました。それに伴い、樹冠数が4328から減少しております。 2. 属性値の変更 1. plot 小川のプロット名が間違えていたため修正しました。 2. stem_ID, indv_ID 基本的にはデータペーパーのTableS3に記載された値を使用しておりますが、一部のサイトではMoni1000の公開データでTableS3に記載された値の更新がなされていなかったため、他の属性値を使用しております。 3. spc_latin, spc_japan Moni1000公開データ内で一部個体の種名変更がありました。またspc_latinについて、従来の樹冠データセット内に異名扱いの学名が含まれていたため、YListを参考に正名に書き換えました。これらに伴い、収録種数が151種から減少しております。 4. gbh_latest, gbh_date 毎木調査票に記載された利用可能な最新の値に更新しました。 5. ca_m2 一部の樹冠で樹冠面積の値に不備があったため修正しました。 6. isDead 最新の毎木調査票内で死亡と表記されている個体の属性値を変更しました。 7. confidence 不明であった一部個体の種名が判明したため値を更新しました。 3. 属性値の追加 1. schm_min, schm_mean, schm_media, schm_sd, schm_max 従来のCHMについて、局地的なノイズによる外れ値が観察されたため、5ピクセル四方の中央値フィルターを適用させることでノイズ除去を実施しました。平滑化したCHMより各種統計量を計算し、樹冠ポリゴン内に格納しました。中央値は、Shapefileの列名の文字数制限の影響でschm_meidaの表記になっています。 2. gbh_isVine 最新の毎木調査内で、ツル込みで測定されていた場合、TRUEになっております。 竹重龍一 竹重龍一 京都大学農学研究科; 国立環境研究所 Kyaw Kyaw Htoo 京都大学農学研究科 大西信徳 DeepForest Technologies Co., Ltd. MD Farhadur Rahman Bangabandhu Sheikh Mujibur Rahman Agricultural University 小野田雄介 京都大学農学研究科 Drone Forest census JaLTER The Monitoring Sites 1000 Project Natural forest Forest dynamics Tree inventory DTM CHM DEM Ortho mosaic photo Crown polygons Crown boundry Crown area No_Dictionary Biological Classification > Plants > Angiosperms (flowering Plants) > Dicots Biological Classification > Plants > Gymnosperms > Conifers Biosphere > Ecological Dynamics > Community Dynamics > Biodiversity Functions Biosphere > Ecological Dynamics > Community Dynamics > Community Structure Biosphere > Ecological Dynamics > Community Dynamics > Species Dominance Indices Biosphere > Ecological Dynamics > Community Dynamics > Plant Succession Biosphere > Ecological Dynamics > Community Dynamics > Species Recruitment Biosphere > Ecological Dynamics > Ecosystem Functions > Biomass Dynamics Biosphere > Terrestrial Ecosystems > Forests Biosphere > Vegetation > Biomass Biosphere > Vegetation > Canopy Characteristics Biosphere > Vegetation > Carbon Biosphere > Vegetation > Crown Biosphere > Vegetation > Deciduous Vegetation Biosphere > Vegetation > Dominant Species Biosphere > Vegetation > Evergreen Vegetation Biosphere > Vegetation > Forest Composition/Vegetation Structure Biosphere > Vegetation > Indigenous Vegetation Biosphere > Vegetation > Leaf Characteristics Biosphere > Vegetation > Plant Characteristics Biosphere > Vegetation > Vegetation Cover Biosphere > Vegetation > Vegetation Species Climate Indicators > Land Surface/Agriculture Indicators > Vegetation Cover Land Surface > Landscape > Landscape Ecology Land Surface > Topography > Terrain Elevation Spectral/Engineering > Lidar GCMD_science Aircraft > UAV In Situ Land-based Platforms > FIELD INVESTIGATION In Situ Land-based Platforms > FIELD SURVEYS In Situ Land-based Platforms > FIXED OBSERVATION STATIONS In Situ Land-based Platforms > GROUND-BASED OBSERVATIONS Models > DEM GCMD_platform BIOGEOSCIENCES > Biodiversity BIOGEOSCIENCES > Data sets BIOGEOSCIENCES > Ecosystems, structure and dynamics BIOGEOSCIENCES > Plant ecology BIOGEOSCIENCES > Remote sensing AGU Ecosystems Biodiversity GEOSS Biodiversity Carbon (stores, uptake, flux) Elevation Ecosystem Function/Dynamics Forest Cover Forest Structure Slope Angle Vegetation Cover Vegetation Type GEO_COP Asia > Eastern Asia > Japan Country 本データセットはCC-BY-NC 4.0ライセンスの下配布される。本データセットを用いて得られた成果には、本データセットに関するデータペーパー（Takeshige et al. 2025, Ecological Research）を適切に引用し、データセットの利用を明記しなければならない。特に、本データセットを利用して学術論文を発表する場合、データ公開から少なくとも2年間（2027年3月31日まで）は、事前にデータ保有者の許可を得ること。研究の目的に応じて、データ作成者を共著者とすることが求められる場合がある。本データセット作成者は、本データセットの利用によって生じた損失・損害について、一切の責任を負わない。 CC-BY-NC 4.0 : Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/ 本研究では、Takeshige et al. (2025, Ecological Research) で発表されたデータセットを用いた。またこのデータセットは、文部科学省の補助事業により開発・運用されているデータ統合解析システム(DIAS)の下で，収集・提供されたものである。 Japanese biota elevation environment geoscientificInformation boundaries location structure このデータセットは、環境省モニタリングサイト1000プロジェクトの森林調査区を利用している。各調査区の樹木調査のデータには、以下のURLよりアクセスできる。 https://www.biodic.go.jp/moni1000/findings/data/index_file.html Only one time 128.23 143.51 26.74 44.37 山地斜面 Mountain slope 2022-05-18 2023-10-31 http://doi.org/10.1111/1440-1703.12555 https://doi.org/10.1016/j.foreco.2024.122185 全国天然林試験区_高解像度地形・森林構造・樹冠データ 2025-03-07 2025-03-27 2025-06-27 ver. 2.0 Moni1000_UAVLiDAR_Crowns20250701223921-DIAS20221121113753-ja 本MD_DataIdentificationクラスには、プロジェクトに関する識別情報を記載している DIAS事務局 国立研究開発法人海洋研究開発機構 金沢区昭和町3173番25 横浜市 神奈川県 236-0001 日本 dias-office at diasjp dot net DIAS > Data Integration and Analysis System No_Dictionary データ提供者がデータ利用規約を定めていない場合は，DIASサービス利用規約（https://diasjp.net/terms/）およびDIASプライバシーポリシー（https://diasjp.net/privacy/）が適用されます． DIASサービス利用規約とデータ提供者によるデータ利用規約に齟齬がある場合は，データ提供者によるデータ利用規約が優先して適用されます． このデータセットを利用して学会発表，論文発表，誌上発表，報告などを行う場合は，以下を参考に謝辞を記載すること．また，データ提供者が示す謝辞の記載方法がある場合は，それも併記すること． “ 本研究では、[データ提供者の名称]が提供する[データセットの名称]を利用した．またこのデータセットは、文部科学省の補助事業により開発・運用されているデータ統合解析システム(DIAS)の下で，収集・提供されたものである． ” データ提供者がデータ利用規約を定めていない場合は，DIASサービス利用規約（https://diasjp.net/terms/） の免責事項に関する規定が適用されます． DIASサービス利用規約とデータ提供者によるデータ利用規約に齟齬がある場合は，データ提供者によるデータ利用規約が優先して適用されます． Japanese Moni1000_UAVLiDAR_Crowns ver 2.0 DTMs, CHMs, Ortho-mosaic photos: Geotiff; Crown polygons: ESRI shapefile https://data.diasjp.net/dl/storages/filelist/dataset:669 ファイルダウンロード http://doi.org/10.1111/1440-1703.12555 本データセットのデータペーパー