GRENE_ei_EcoBiodiv_MAPHATJP_データセット

1. 識別情報

名称 GRENE_ei_EcoBiodiv_MAPHATJP_データセット
版 0.9
略称 MAPHATJP
メタデータID GRENE_ei_EcoBiodiv_MAPHATJP20240612163941-ja

2. 問合せ先

2.1 データセットに関する問合せ先

名前 倉島 治
組織名 東京大学
住所 日本, 153-8902, 東京都, 目黒区, 駒場 3-8-1
電話番号 +81-3-5454-4305
ファクシミリ番号 +81-3-5454-4305
電子メールアドレス osamu@darwin.c.u-tokyo.ac.jp

2.2 プロジェクトに関する問合せ先

3. ドキュメント作成者

名前 倉島 治
組織名 東京大学
電子メールアドレス osamu@darwin.c.u-tokyo.ac.jp

4. データ作成者

名前 斎藤昌幸
組織名 東京農工大学
電子メールアドレス saito.ume@gmail.com

5. ドキュメント作成年月日

2024-06-12

6. データ作成年月日

  • creation : 2016-03-18

  • revision : 2016-04-01

7. データセット概要

7.1 序論

本データセットは、1188種の植物生育適地推定データです。日本標準メッシュの第3次メッシュ解像度で整備されています。環境省植生調査（2000-2012年）より抽出した出現種データを応答変数として生育適地を推定しています。説明変数となる環境要因は、年平均気温、夏季降水量、冬季降水量、地形的土壌湿性度指数（TWI）、地形区分（低地・丘陵・山地の 3カテゴリー）、火山性物質（表層地質）の有無、石灰岩（表層地質）の有無、超塩基性岩（表層地質）の有無、周辺二次植生割合、周辺植林割合、周辺農地割合、周辺都市割合となります。これら変数は全て第3次メッシュ解像度データになります。土地利用割合（周辺二次植生割合、周辺植林割合、周辺農地割合、周辺都市割合）は、該当する 3次メッシュの周囲 8メッシュも含めて合計 9メッシュ分から算出しています。植物種ごとの分布モデル構築には、MaxEnt（http://www.cs.princeton.edu/∼schapire/maxent/）を利用しています。

7.2 トピックカテゴリ(ISO19139)

  • environment

  • biota

7.3 時間情報

開始日 2000-01-01
終了日 2012-12-31

7.4 地理的範囲

北限緯度 45.508
西限経度 122.875
東限経度 145.762
南限緯度 24.000

7.5 グリッド

次元の名称 次元の分割数 次元の解像度
row 1 30 (second)
column 1 45 (second)

7.6 地理情報を識別する名称

7.7 キーワード

7.7.1 データセットに関連するキーワード

キーワードタイプ キーワード シソーラス名
place Asia > Eastern Asia > Japan Country
theme Ecosystems, Biodiversity GEOSS
theme Biodiversity GEO_COP

7.7.2 プロジェクトに関連するキーワード

7.8 データセットに関するオンライン情報

7.9 データ周辺情報

7.10 データ配布情報

配布識別名 配布バージョン 配布に関する説明
CSV RFC 4180
GeoTIFF TIFF 6.0

8. 系譜情報

8.1 データ処理 (1)

8.1.1 データセット作成に関する加工過程や履歴の説明

本データセットに利用されている環境変数

01. 年平均気温：WorldClim v1.4 (Hijmans et al., 2005) より作成。

02. 夏季降水量：WorldClim v1.4 (Hijmans et al., 2005) より作成。

03. 冬季降水量：WorldClim v1.4 (Hijmans et al., 2005) より作成。

04. 地形的土壌湿性度指数（TWI）：数値地図50mメッシュ（国土地理院, 2001）より作成。

05. 地形区分：若松ら（2005）を再分類して作成（低地・丘陵・山地の 3カテゴリー）。

06. 火山性物質（表層地質）：国土数値情報（土地分類メッシュ昭和54年度）（国土交通省, 2002）より作成。

07. 石灰岩（表層地質）：国土数値情報（土地分類メッシュ昭和54年度）（国土交通省, 2002）より作成。

08. 超塩基性岩（表層地質）：国土数値情報（土地分類メッシュ昭和54年度）（国土交通省, 2002）より作成。

09. 周辺二次植生割合：小川ら (2013) および Akasaka et al. (2014) を利用して第 5回自然環境保全基礎調査植生図（環境庁, 1999）を再分類して作成。該当する 3次メッシュの周囲 8メッシュも含めて合計 9メッシュ分から算出。

10. 周辺植林割合：小川ら (2013) および Akasaka et al. (2014) を利用して第 5回自然環境保全基礎調査植生図（環境庁, 1999）を再分類して作成。該当する 3次メッシュの周囲 8メッシュも含めて合計 9メッシュ分から算出。

11. 周辺農地割合：小川ら (2013) および Akasaka et al. (2014) を利用して第 5回自然環境保全基礎調査植生図（環境庁, 1999）を再分類して作成。該当する 3次メッシュの周囲 8メッシュも含めて合計 9メッシュ分から算出。

12. 周辺都市割合：小川ら (2013) および Akasaka et al. (2014) を利用して第 5回自然環境保全基礎調査植生図（環境庁, 1999）を再分類して作成（面積率）。該当する 3次メッシュの周囲 8メッシュも含めて合計 9メッシュ分から算出。

本データセットに利用されている応答変数

出現植物（分布）：環境省第6-7回植生調査（2000〜2012年調査分）より作成。対象は 50 地点以上から出現している 1188 種。なお、種名（和名および学名）は Ylist (米倉・梶田, 2003) をもとに整理。

8.1.2 元データの情報

データ起源の引用名 加工するデータ起源の説明

9. 品質等

10. 利用規約

10.1 データ提供者によるデータ利用規約

本データセットは、クリエイティブ・コモンズ・ライセンス（Creative Commons）CC BY-SA 4.0でご利用になれます。

10.2 プロジェクトによるデータ利用規約

11. ライセンス

12. 謝辞の記載方法

12.1 データ提供者の指定による謝辞の記載方法

ご利用の際は、以下のように引用あるいは成果物に明記してください。

Saito M.U., Kurashima O., Ito M., 2016. Maps of potential habitats for Japanese plant species. Available at http://gnetum.c.u-tokyo.ac.jp/maphatjp/.

12.2 プロジェクトの指定による謝辞の記載方法

13. 参考文献